Det brittiska partiet har sagt att de kommer att samarbeta med utredningen.
"Vi kontaktade Labour efter att vi fått ett antal klagomål gällande anklagelser om antisemitism inom partiet", skriver kommissionen i ett uttalande.
Labour har de senaste två åren dragits med anklagelser och vittnesmål om antisemitism inom partiet men förnekat att det förekommer någon sådan.
Nio personer lämnade partiet i februari i år, bland annat med hänvisning till att ledningen inte tog anklagelserna på allvar.