Straffet är det strängaste hittills vid Internationella brottmålsdomstolen (ICC) i Haag.
Ntaganda fälls på 18 punkter som faller under krigsbrott och brott mot mänskligheten: mord på civila, våldtäkter, sexuellt slaveri, förföljelser och rekrytering av barnsoldater.
Brotten begicks när den nu 46-årige Ntaganda var operativ militär befälhavare för UPC-milisen i östra Kongo-Kinshasa 2002–2003.
Enligt domaren finns inga förmildrande omständigheter.